Bilgi

12.8: Referanslar - Biyoloji

12.8: Referanslar - Biyoloji


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Amberg DC, Burke DJ & Strathern JN (2005) Maya Genetiğinde Yöntemler. Cold Spring Harbor Laboratuvar Presi, Cold Spring Harbor.

Gietz RD & Schiestl RH (2007) LiAc/SS taşıyıcı DNA/PEG yöntemi kullanılarak yüksek verimli maya transformasyonu. Nat Protokolü 2: 31-34.

Johnston, M (1987) Bir model mantar düzenleyici mekanizma: GAL1 genleri Saccharomyces cerevisiae. Mikrobiyol Rev 51: 458-476.

Winzeler, EA, Ayakkabıcı, DD, Astromoff, A ve diğerleri (1999) Fonksiyonel karakterizasyonuSaccharomyces cerevisiae gen silme ve paralel analiz yoluyla genom. Bilim 285: 901-906.


Biyoloji (şarkı)

"Biyoloji" İngiliz-İrlandalı kadın pop grubu Girls Aloud'un üçüncü stüdyo albümlerinden alınan bir şarkı. Kimya (2005). Şarkı Miranda Cooper, Brian Higgins ve Higgins'in yapım ekibi Xenomania tarafından yazıldı ve Higgins ve Xenomania tarafından üretildi. Farklı bölümlerden oluşan bu eser, çoğu çağdaş pop müziğinde bulunan nazım-koro biçiminden kaçınır. "Biology", albümün yayınlanmasından önce Kasım 2005'te single olarak yayınlandı. "Long Hot Summer"daki hayal kırıklığının ardından, "Biology" Girls Aloud'u UK Singles Chart'ın ilk beşine geri döndürdü ve onuncu ilk on hiti oldu.

Sadece grup çekimlerinden oluşan müzik videosu, Girls Aloud'un ayrık koreografi yaparken çeşitli sekanslarda sorunsuz bir şekilde ilerlediğine tanık oluyor. "Biology" bir dizi canlı performansla tanıtıldı ve o zamandan beri Girls Aloud'un sonraki tüm konser turlarında gerçekleştirildi. Çeşitli tarzları içeren şarkı, çağdaş müzik eleştirmenlerinden büyük beğeni topladı. Girls Aloud'un imza şarkılarından biri olarak kabul edildi, Gardiyan "Biology", "son on yılın en iyi pop single'ı" olarak anılır.


12.8: Referanslar - Biyoloji

MDPI tarafından yayınlanan tüm makaleler, bir açık erişim lisansı altında dünya çapında anında kullanıma sunulmaktadır. Şekil ve tablolar dahil olmak üzere MDPI tarafından yayınlanan makalenin tamamının veya bir kısmının yeniden kullanılması için özel bir izin gerekmemektedir. Açık erişim Creative Common CC BY lisansı altında yayınlanan makaleler için, orijinal makaleden açıkça alıntı yapılması şartıyla makalenin herhangi bir kısmı izinsiz olarak yeniden kullanılabilir.

Özellik Belgeleri, alanda yüksek etki için önemli potansiyele sahip en gelişmiş araştırmaları temsil eder. Özellik Bildirileri, bilimsel editörlerin bireysel daveti veya tavsiyesi üzerine sunulur ve yayınlanmadan önce hakem değerlendirmesine tabi tutulur.

Özellik Belgesi, orijinal bir araştırma makalesi, genellikle birkaç teknik veya yaklaşımı içeren önemli bir yeni araştırma çalışması veya bilimsel alandaki en heyecan verici gelişmeleri sistematik olarak gözden geçiren, alandaki en son ilerleme hakkında kısa ve kesin güncellemeler içeren kapsamlı bir inceleme makalesi olabilir. Edebiyat. Bu tür kağıt, gelecekteki araştırma yönleri veya olası uygulamalar hakkında bir görünüm sağlar.

Editörün Seçimi makaleleri, dünyanın her yerinden MDPI dergilerinin bilimsel editörlerinin tavsiyelerine dayanmaktadır. Editörler, yazarlar için özellikle ilginç olacağına veya bu alanda önemli olacağına inandıkları dergide yakın zamanda yayınlanan az sayıda makaleyi seçerler. Amaç, derginin çeşitli araştırma alanlarında yayınlanan en heyecan verici çalışmalardan bazılarının anlık görüntüsünü sağlamaktır.


Veri ön işleme

Araştırmacılar, Cistrome platformunu kullanarak ChIP-chip veya ChIP-seq verilerinden elde edilen biyolojik sonuçları yorumlamadan önce, mikrodizi veya sıralama tesislerinden ham verileri yükleyebilir ve ardından bu verileri Cistrome tepe arama araçlarını kullanarak önceden işleyebilir. Alternatif olarak, araştırmacılar kendi analiz araçlarından ara sonuçları da yükleyebilirler. Şekil l'de gösterildiği gibi, tepe arama adımı iki tür ara dosya üretir: tahmin edilen transkripsiyon faktörü bağlanma sitelerini veya histon modifikasyon sitelerini gösteren tepe konum dosyaları (BED formatında) ve bağlanma veya bağlanmanın sinyal profili dosyaları (WIGGLE formatında). Genom boyunca histon modifikasyonu.

Verileri Cistrome'a ​​aktarmak için çeşitli yöntemler kullanılabilir. 'Dosya Yükle' işlevi, Galaxy'de olduğu gibi kullanıcının bilgisayarından veya bir HTTP veya FTP dosya sunucusundan bir dosya içe aktarabilir. Çoğu durumda, sıralama tesisleri düşük seviyeli baz aramasını yönetecek ve haritalama işlemlerini okuyacaktır. İzin verdiğimiz en az işlenen Cistrome veri biçimleri, ChIP-seq dizileme eşleme sonuçları için SAM/BAM [7] veya BED biçimleri, Affymetrix döşeme dizilerini kullanan ChIP-chip için CEL dosyaları veya NimbleGen özel dizilerinden PAIR dosyalarıdır. Araştırmacılar, genomdaki ilgili bölgeler için BED formatındaki dosyalar veya sinyal bilgisi için WIGGLE formatındaki dosyalar gibi ara sonuçlar üretmek için başka algoritmaları zaten kullanmış olabilirler. Bu gibi durumlarda, kullanıcılar ayrıca ara sonuç dosyalarını Cistrome'a ​​yükleyebilir ve kabul edilebilir formatları dikkate alarak aşağı akış araçlarımızı uygulayabilir (Ek dosya 1'deki Tablo S1). Ek olarak, Affymetrix ve NimbleGen teknolojilerinden ekspresyon mikrodizi veri kümeleri için iki yeni veri türü uyguladık. Ham ifade mikrodizi verileri ve fenotip bilgilerini açıklayan bir metin dosyası (örneğin, transkripsiyon faktörü aktivasyonundan önce ve sonra), genel yükleme aracı aracılığıyla yüklenmeden önce bir zip dosyasında paketlenmelidir.

Cistrome, hem ChIP-chip hem de ChIP-seq verileri için tepe arama araçları içerir. Affymetrix promotörü veya döşeme dizileri için MAT aracını [8] kullandık ve dokuz farklı dizi tasarımını destekledik. Caenorhabditis elegans insana. Affymetrix CEL dosyaları giriş olarak gereklidir. NimbleGen iki renkli diziler için MA2C [9] konuşlandırıldı. Araştırmacılar genellikle kendi özelleştirilmiş NimbleGen iki renkli dizi tasarımlarına sahip olduklarından, dizi tasarımı (.ndf) ve konum (.pos) dosyaları ve ham prob ham sinyal dosyalarının (.pair) tümü, Cistrome web sitesinde MA2C'yi çalıştırmak için yüklenmelidir. Hem MAT hem de MA2C, kontrol verilerini işleyebilir veya giriş verileri olarak çoğaltabilir ve çıkış olarak tepe konumları için bir BED dosyası ve normalleştirilmiş prob sinyalleri için WIGGLE dosyası oluşturabilir. Cistrome, çeşitli kısa okuma sıralayıcılarından (örneğin, Illumina'dan Genome Analyzer ve HiSeq 2000 veya Applied Biosystems'den SOLiD) elde edilen ChIP-seq verileri için MACS (ChIP-Seq'in Model Tabanlı Analizi) [10] aracı sağlar. MACS, sıralanmış ChIP parçalarının uzunluğunu ve kromatin açıklığından kaynaklanan yerel yanlılığı modelleyerek öngörülen bağlanma bölgelerinin doğruluğunu artırabilir. MACS, kontrollerle veya kontroller olmadan çalışabilir ve yaygın olarak kullanılan SAM/BAM formatına ve diğer altı eşleme sonucu formatına (Ek dosya 1'deki Tablo S1) girdi olarak izin verir. Çıktılar, BED formatında pik bölgeleri ve pik zirveleri (algoritma tarafından tahmin edilen kesin bağlanma konumu) ve WIGGLE formatında her 10 bp'de tüm genom boyunca ChIP fragman yığınını içerir. Tanılama seçeneği açıldığında, MACS, bir alt kümeden kurtarılabilecek tepe noktalarının sayısını belirlemek için verileri alt örneklerle alır, böylece mevcut sıralama derinliğinin doygunluk durumunu tahmin eder. BAM veya SAM formatında tek uçlu veya çift uçlu dizilemeyi destekleyen MACS sürüm 1.4rc2'yi Cistrome'a ​​yerleştirdik.

Halka açık havuzlarda ChIP-chip ve ChIP-seq veri kümelerinin hızlı büyümesiyle, çapraz platformdan ve laboratuvarlar arası ChIP-chip veya ChIP-seq veri kümelerinden gelen bilgileri entegre edebilmek giderek daha önemli hale geldi. Yakın zamanda güçlü meta-analiz aracı MM-ChIP'yi (ChIP verilerinin Model-tabanlı Meta-analizi) geliştirdik [11] ve onu Cistrome'un en çok arayan uygulama kategorisi altında devreye aldık. MM-ChIP aracı iki ayrı işlev içerir: MMChIP-chip, MA2C ve MAT araçlarından gelen WIGGLE dosyalarına dayalı olarak ChIP-chip meta-analizini gerçekleştirir ve MMChIP-seq, farklı ChIP-seq kitaplıklarını birleştirmek için girdi olarak BED formatında NGS hizalamalarını kullanır. Aynı koşullar altında aynı faktörün Ortaya çıkan tepe konumları (BED dosyalarında) ve sinyal profilleri (WIGGLE dosyalarında), UCSC genom tarayıcısında özel bir iz olarak görselleştirilebilir ve daha sonra tartışılacak olan diğer aşağı akış analiz araçları için girdi olarak kullanılabilir. Farklı platformlar veya amaçlar için bu spesifik tepe çağırıcılara ek olarak, Cistrome'da herhangi bir genom sinyal profilini WIGGLE formatında alabilen, sinyalleri normalleştirebilen ve daha sonra bir null ile karşılaştırarak önemli bölgeleri bulmaya çalışan genel bir tepe çağırıcı vardır. arka plan verilerinden oluşturulan dağıtım.


12.8: Referanslar - Biyoloji

MDPI tarafından yayınlanan tüm makaleler, bir açık erişim lisansı altında dünya çapında anında kullanıma sunulmaktadır. Şekil ve tablolar dahil olmak üzere MDPI tarafından yayınlanan makalenin tamamının veya bir kısmının yeniden kullanılması için özel bir izin gerekmemektedir. Açık erişim Creative Common CC BY lisansı altında yayınlanan makaleler için, orijinal makaleden açıkça alıntı yapılması şartıyla makalenin herhangi bir kısmı izinsiz olarak yeniden kullanılabilir.

Özellik Belgeleri, alanda yüksek etki için önemli potansiyele sahip en gelişmiş araştırmaları temsil eder. Özellik Bildirileri, bilimsel editörlerin bireysel daveti veya tavsiyesi üzerine sunulur ve yayınlanmadan önce hakem değerlendirmesine tabi tutulur.

Özellik Belgesi, orijinal bir araştırma makalesi, genellikle birkaç teknik veya yaklaşımı içeren önemli bir yeni araştırma çalışması veya bilimsel alandaki en heyecan verici gelişmeleri sistematik olarak gözden geçiren, alandaki en son ilerleme hakkında kısa ve kesin güncellemeler içeren kapsamlı bir inceleme makalesi olabilir. Edebiyat. Bu tür kağıt, gelecekteki araştırma yönleri veya olası uygulamalar hakkında bir görünüm sağlar.

Editörün Seçimi makaleleri, dünyanın her yerinden MDPI dergilerinin bilimsel editörlerinin tavsiyelerine dayanmaktadır. Editörler, yazarlar için özellikle ilginç olacağına veya bu alanda önemli olacağına inandıkları dergide yakın zamanda yayınlanan az sayıda makaleyi seçerler. Amaç, derginin çeşitli araştırma alanlarında yayınlanan en heyecan verici çalışmalardan bazılarının anlık görüntüsünü sağlamaktır.


12.8: Referanslar - Biyoloji

MDPI tarafından yayınlanan tüm makaleler, bir açık erişim lisansı altında dünya çapında anında kullanıma sunulmaktadır. Şekil ve tablolar dahil olmak üzere MDPI tarafından yayınlanan makalenin tamamının veya bir kısmının yeniden kullanılması için özel bir izin gerekmemektedir. Açık erişim Creative Common CC BY lisansı altında yayınlanan makaleler için, orijinal makaleden açıkça alıntı yapılması şartıyla makalenin herhangi bir kısmı izinsiz olarak yeniden kullanılabilir.

Özellik Belgeleri, alanda yüksek etki için önemli potansiyele sahip en gelişmiş araştırmaları temsil eder. Özellik Bildirileri, bilimsel editörlerin bireysel daveti veya tavsiyesi üzerine sunulur ve yayınlanmadan önce hakem değerlendirmesine tabi tutulur.

Özellik Belgesi, orijinal bir araştırma makalesi, genellikle birkaç teknik veya yaklaşımı içeren önemli bir yeni araştırma çalışması veya bilimsel alandaki en heyecan verici gelişmeleri sistematik olarak gözden geçiren, alandaki en son ilerleme hakkında kısa ve kesin güncellemeler içeren kapsamlı bir inceleme makalesi olabilir. Edebiyat. Bu tür kağıt, gelecekteki araştırma yönleri veya olası uygulamalar hakkında bir görünüm sağlar.

Editörün Seçimi makaleleri, dünyanın her yerinden MDPI dergilerinin bilimsel editörlerinin tavsiyelerine dayanmaktadır. Editörler, yazarlar için özellikle ilginç olacağına veya bu alanda önemli olacağına inandıkları dergide yakın zamanda yayınlanan az sayıda makaleyi seçerler. Amaç, derginin çeşitli araştırma alanlarında yayınlanan en heyecan verici çalışmalardan bazılarının anlık görüntüsünü sağlamaktır.


Soyut

Mikroplar hayatın anahtarıdır. Onlar, (en erken yaşam formlarının torunları olarak) geçmişimizin sırlarını ve (küresel ısınmadan antibiyotik direncine kadar gezegenin en acil sorunlarından bazılarına çözümler için onların genlerini çıkarırken) geleceğimize dair umutları saklıyorlar. Bununla birlikte, 20 yılı aşkın bir süredir mikrobiyal genetik çeşitliliği araştırma çabalarını tanımlayan ve 30.000'den fazla genom projesinde yer alan parça parça yaklaşım, bu vaadi boşa harcama riskini taşıyor. Bu çabalar, bilinen genel prokaryotik çeşitliliğin sadece %15'ini temsil eden, kültürlenmiş arke ve bakteri türlerinin çeşitliliğinin %20'sinden daha azını kapsıyor. Burada, geçerli olarak yayınlanmış bir ada sahip (şu anda 11.000) her türün tip suşu, mümkün olduğunda, dizileme yoluyla tüm kültürlenmiş Bakteriler ve Arkelerin kapsamlı bir genomik kataloğunu üretmek için sistematik bir çabanın finansmanı için çağrıda bulunuyoruz. Bu çaba, gezegenimizin genetik çeşitliliğinin eşi görülmemiş bir kapsamını sağlayacak, yeni genlerin ve işlevlerin büyük ölçekli keşfine izin verecek ve çevredeki mikrobiyal evrim ve işlevin daha iyi anlaşılmasına yol açacaktır.

Alıntı: Kyrpides NC, Hugenholtz P, Eisen JA, Woyke T, Göker M, Parker CT, et al. (2014) Bakteri ve Arkelerin Genomik Ansiklopedisi: Sayısız Tip Suşunu Sıralama. PLoS Biol 12(8): e1001920. https://doi.org/10.1371/journal.pbio.1001920

Yayınlanan: 5 Ağustos 2014

Telif hakkı: © 2014 Kyrpides ve diğerleri. Bu, orijinal yazar ve kaynağın belirtilmesi koşuluyla herhangi bir ortamda sınırsız kullanım, dağıtım ve çoğaltmaya izin veren Creative Commons Atıf Lisansı koşulları altında dağıtılan açık erişimli bir makaledir.

Finansman: Bu çalışma, DE-AC02-05CH11231 sözleşmesi kapsamında ABD Enerji Bakanlığı Bilim Ofisi tarafından desteklenmektedir. Finansörlerin çalışma tasarımı, veri toplama ve analizi, yayınlama kararı veya makalenin hazırlanmasında hiçbir rolü yoktu.

Rekabet eden ilgi alanları: Yazarlar, rekabet eden çıkarların olmadığını beyan etmişlerdir.

Topluluk Sayfası, kuruluşların ve toplulukların bilimsel bilginin yayılmasını ve değerini artırma çabalarını vurguladıkları bir forumdur.


Dinleyin: Pediatrik biyoloji ve araştırma üzerine Priscilla Chan: "Çocuklar küçük yetişkinler değildir"

On yıl öncesinin daha iyi yanı buydu. Bugün, tek hücreli biyolojideki büyük ilerlemeler, araştırmacıların yaşamın yapı taşlarını, yani tek hücreleri incelemesine olanak tanıyan teknolojilerin ve tekniklerin uygulanması sayesinde işler değişmeye hazırlanıyor.

Son birkaç yıldır araştırmacılar, yetişkin insan vücudundaki her hücre tipi için referans haritaları oluşturuyorlar. Tek hücre teknolojilerinin ürettiği zengin veri ve çözünürlük, insan biyolojisi anlayışımızı şimdiden dönüştürüyor. Ayrıca, tek tek hücrelerde hastalıkla ilişkili genlerin aktivitesini ve sağlıklı bireylerde gen aktivitesini tanımlayarak, nadir hastalıklar da dahil olmak üzere hastalık için hücresel mekanizmaları ortaya çıkarabilirler. Örneğin, araştırmacılar, insan hava yolunda bilim adamlarının kistik fibroz için yeni ve gelişmiş tedaviler geliştirmelerine yardımcı olabilecek yeni bir hücre tipini tanımlamak için tek hücreli RNA dizilimini kullandılar.

Tek hücre teknolojisi, bilim adamlarının burundaki Covid-19'a neden olan virüs olan SARS-CoV-2 tarafından enfeksiyona duyarlı hücre tiplerini hızlı bir şekilde tanımlamasına da izin verdi.

Sorun şu ki, tek hücreli biyoloji ve tıptaki bu devrim henüz pediatride tam olarak ulaşamadı. Bu toplulukta tek hücreli araştırmalar için enerji veya tutku eksikliği yoktur. Ancak bir dizi sistemik engel, kalkışını engelliyor.

Bu engellerden biri finansman ya da daha doğrusu yetersiz finansmandır. Ulusal Sağlık Enstitüleri bütçesinin bir yüzdesi olarak, pediatrik araştırmalara verilen destek, 1998'de %12,8'den 2015'te sadece %1,7'ye istikrarlı bir şekilde düşmüştür. Pediatrik araştırmalar için NIH desteği 2015'ten bu yana artmış olsa da, hala yeterli değildir. Ücret başka bir konudur: Pediatristler hemen hemen tüm diğer doktorlardan daha az kazanırlar, bu da birçoğunun daha uzun klinik saatler çalışmasına ve aksi takdirde üstlenebilecekleri araştırma projelerinden vazgeçmesine neden olur.

Zorluklar bununla da bitmiyor. Finansman sağlayabilen tek hücreli araştırmacılar, sadece hasta hastalardan değil aynı zamanda sağlıklı olanlardan da çalışmak için doku örneklerine ihtiyaç duyarlar. Ancak bu tür numunelerin her ikisi de yetersizdir. Hastaların ve ailelerinin, ameliyat sırasında alınan dokular gibi sağlıklı dokuları bağışlamaları için her zaman net bir neden yoktur. Ve herhangi bir örneğe katkıda bulunma süreci özellikle dolu olabilir. Aileler, tıptaki tarihsel ve ayrımcı uygulamalar nedeniyle mahremiyet konusunda endişe duyabilir veya güvensizlik hissedebilir. Veya araştırmaya katılımın mümkün olduğunun bile farkında olmayabilirler.

Araştırmanın önündeki engeller ne kadar çetin olursa olsun, pediatri topluluğu içindeki liderler bunların üstesinden gelinebileceklerini kanıtladılar. 200'den fazla çocuk hastanesinde 10.000'den fazla uzmanı bir araya getiren Çocuk Onkolojisi Grubu'nu ele alalım. 1955 yılında kurulduğundan bu yana, bu topluluk ailelerin pediatrik kanser araştırmalarına katılma ve bunun için doku örneklerine katkıda bulunma konusunda kendilerini güvende hissetmelerine ve bilgi sahibi olmalarına yardımcı olmuştur. Grup, etkili gizlilik ve rıza standartlarını uygulamak için doğrudan ebeveynlerle birlikte çalıştı. Pediatrik kanser araştırma grupları arasında veri paylaşımının istisnadan ziyade kural olduğu bir paradigmanın kurulmasına yardımcı oldu.

Sonuçlar kendileri için konuşur. Çocukluk çağı kanseri araştırmaları arttıkça, hayatta kalma oranları 1950'lerde %10'un altındayken bugün yaklaşık %80'e yükseldi. Başka bir deyişle, aksi takdirde ölebilecek yüz binlerce çocuk sağlıklı ve doyurucu bir yaşam sürmek için büyüdü.

Pediatri, tek hücreli biyolojinin birçok çocukluk hastalığının kökenini deşifre etmeye yardımcı olabileceği bir dönüm noktasına ulaştı.

Bunu akılda tutarak, kurucularından olduğum hayırseverlik kuruluşu Chan Zuckerberg Girişimi (CZI) bu tür bir işbirliğini destekliyor. Tek hücreli araştırmaları ilerletmek için hastaları, aileleri, klinisyenleri ve araştırmacıları bir araya getirmeyi ve nihayetinde bilim adamlarının erişip analiz edebileceği tüm sağlıklı pediatrik dokuların açık kaynaklı bir referans haritasını oluşturmayı ve paylaşmayı amaçlar.

Bu yaklaşıma rehberlik eden birkaç ilke vardır. CZI, disiplinler arası veri bilimci ekiplerini, tek hücreli biyoloji uzmanlarını ve hastaları görmeye devam eden çocuk doktorlarını finanse ediyor. Amaç, her bir işbirliğinin temel bilim araştırmalarını net pratik uygulamalarla dengelemesini ve numune sağlamaya gönüllü olan ailelerin ihtiyaçları hakkında bilgi sahibi olmasını sağlamaktır.

Bu ekipler, bilim insanlarının sağlıklı hücrelerin nasıl çalıştığını ve hastalıklarda neyin yanlış gittiğini anlamalarına yardımcı olmak için insan vücudundaki tüm hücrelerin haritasını çıkarmayı amaçlayan küresel İnsan Hücresi Atlası da dahil olmak üzere açık bilim projelerine katkıda bulunacak. Pediatrik araştırma topluluğu arasında paylaşılabilecek veya paylaşılması gereken veri miktarının elbette sınırları vardır. Ancak Çocuk Onkoloji Grubu'nun gösterdiği gibi, hasta mahremiyetine saygı gösterirken işbirliğini en üst düzeye çıkarmak ve bunu yaparak olağanüstü ilerleme kaydetmek mümkündür.

Ben ve CZI meslektaşlarım, tek hücreli referans verilerinin, geçmişteki pediatrik araştırma girişimleri tarafından tarihsel olarak yetersiz hizmet almış ve Siyah, Latin, Asyalı ve Yerli popülasyonlar dahil olmak üzere çocukluk hastalıklarından orantısız şekilde muzdarip insanları içermesi gerektiğine kuvvetle inanıyoruz. Bu çocuklar önümüzde duran umudun ve ilerlemenin bir parçası olmalı, dolayısıyla bu araştırma bu topluluklardan ortaklarla yürütülmelidir.

Tek hücreli biyoloji araştırma ağları hala küçük olsa da, daha fazla hasta, ebeveyn, klinisyen, araştırmacı ve kurum bu araştırmanın nereye varabileceğini gördükçe büyüyeceklerini umuyorum. Araştırmacıların çok çeşitli pediatrik hücre tiplerinin haritasını çıkardıkları ve zaman içinde nasıl geliştiklerini bildikleri bir gelecek hayal edin. Bu bilgiyle, bir klinisyen bir hastanın genomunu sıralayabilir ve bir hastalığın ne zaman, nerede ve nasıl ortaya çıkacağını tahmin edebilir. Hastalığın başlangıcının hücresel düzeyde nasıl göründüğünü anlamak ve patoloji başlamadan önce değişen özellikleri tespit edebilmek, olaydan sonra hastalığı yönetmek yerine hastalığı önlememize bile yardımcı olabilir - bu, çocuklara ve yetişkinlere fayda sağlayacak bir gelişme.

Bu gelişmeler hastalar ve aileleri için yaşamı değiştirecek. Terapötik fırsatlar daha da umut verici. Gen ekspresyonu ve hücre tipleri hakkında doğru verilerle donanmış bilim adamları ve çocuk doktorları, herhangi bir sayıda bozukluk için yüksek oranda hedefe yönelik tedaviler geliştirebilirler. Mevcut terapötik stratejileri uygulamak için yeni yollar belirleyebiliriz.

Elbette bu gelecek, herhangi bir araştırma grubunun, ağın veya organizasyonun erişiminin ötesindedir. Hasta ağlarından federal hükümete ve hayırsever fon sağlayıcılara kadar çok çeşitli kurumlarda sürekli yatırım gerektirecektir. Pediatrik araştırmaların ve özellikle tek hücreli araştırmaların değerine ilişkin ortak bir anlayışın geliştirilmesine bağlı olacaktır.

Önümüzdeki çalışmaları düşündüğümde, UCSF'nin sloganı olan "Fiat lux" - Işık olsun - hatırlatılıyor. Pediatri camiasına bir yük olmalı: Karanlıkta kalan hastalıklara yeni bir ışık tutalım. Ve en çok ihtiyacı olan çocuklara ışık olalım.

Priscilla Chan, bir çocuk doktoru ve şirketin kurucu ortağı ve eş-CEO'su. Chan Zuckerberg Girişimi.

Chan'ın "First Opinion Podcast"in bir bölümünde pediatrik araştırmalar hakkında daha fazla konuşmasını dinleyin.


GİRİŞ

Mitokondri, sıklıkla bölünen ve birbiriyle kaynaşan dinamik yapılardır (Bereiter-Hahn ve Voth, 1994 Hermann ve Shaw, 1998). Mitokondriyi yavru hücrelere dağıtmak için hücre bölünmesi sırasında mitokondriyal bölünme gereklidir. Sakin hücreler ayrıca hücre farklılaşması sırasında, hücre büyümesi sırasında veya hücre dışı uyaranlara yanıt olarak mitokondriyal bölünme sergiler. Mitokondriyal bölünme ve füzyon süreçleri sıkı bir şekilde düzenlenmelidir, çünkü hücrenin hayatta kalması, her hücrede yeterli sayıda mitokondrinin korunmasına bağlıdır. Mitokondriyal bölünme ve füzyon mekanizmalarının da karmaşık olması muhtemeldir, çünkü mitokondri, belirgin topolojik ve enerjik bariyerler sunan çift zarlara sahiptir.

Mitokondriyal bölünmenin mekanizmasına dair ilk ipucu, bu sürecin DRP-1 adı verilen dinaminle ilişkili bir protein tarafından kontrol edildiğine dair son keşiflerden geldi. Caenorhabditis elegans (Labrözve diğerleri, 1999) veya mayada Dnm1p (Bleazard ve diğerleri, 1999 Sesaki ve Jensen, 1999). Dnm1p/DRP-1 fonksiyonunun kaybı, hem mitokondriyal bağlantıda bir artışa neden olur. C. elegansve mayada, mitokondriyal bölünmelerin azaltılmış frekansları ile tutarlı olarak (Bleazard ve diğerleri, 1999 ve diğerleri, 1999 Sesaki ve Jensen, 1999). İçinde C. elegans, mitokondriyal iç zar bölünmeye devam eder, bu da DRP-1'in yalnızca mitokondriyal dış zarın bölünmesi için gerekli olduğunu gösterir (Labrousse). ve diğerleri, 1999). Vahşi tip DRP-1'in aşırı ekspresyonu, vücuttaki mitokondriyal bölünme olaylarının sayısını artırır. C. elegans (Labröz ve diğerleri, 1999). İmmünofloresan ve immüno-elektron mikroskopisi, maya Dnm1p'nin epitop etiketli versiyonlarının mitokondri boyunca veya mitokondrinin uçlarında (Bleazard) noktalarda lokalize olduğunu gösterdi. ve diğerleri, 1999). Hızlandırılmış fotoğrafçılık, yeşil floresan protein (GFP) etiketli DRP-1'in C. elegans mitokondriyal bölünmede (Labrousse) doğrudan bir rol ile tutarlı olarak, mitokondri üzerinde fisyonun meydana gelmek üzere olduğu noktalarda lokalizedir. ve diğerleri, 1999). Birlikte ele alındığında, bu sonuçlar güçlü kanıtlar sağlar C. elegans DRP-1 ve maya Dnm1p, mitokondriyal bölünme sürecinin son aşamaları için gereklidir.

memeli homologu C. elegans DRP-1 ve maya Dnm1p alternatif olarak Drp1, Dlp1, DVLP veya Dymple (Shinve diğerleri, 1997 Imoto ve diğerleri, 1998 Kamimotove diğerleri, 1998 Smirnova ve diğerleri, 1998 Yoonve diğerleri, 1998). Burada bu proteini Drp1 olarak adlandırıyoruz. Memeli Drp1'in işlevi hala tartışma konusudur. Drp1'in vezikül oluşumunda dinaminin rolüne benzer bir rol oynayarak vezikül oluşumuna yardımcı olduğu öne sürülmüştür. Bir çalışma, Drp1'in salgı yolunun erken bir aşamasında gerekli olduğunu öne sürdü (Imoto ve diğerleri, 1998). Başka bir çalışma, Drp1'in yeni bir veziküler taşıma yoluna veya endoplazmik retikulum (ER) ile mitokondri (Pitts) arasında doğrudan füzyona katkıda bulunduğunu ileri sürdü. ve diğerleri, 1999). Bu çalışma, veziküler taşıma üzerinde hiçbir etki göstermeyen önceki sonuçlarımızla tutarlı olarak, salgı veya endositik yollar üzerinde hiçbir etki göstermedi (Smirnova). ve diğerleri, 1998). Bunun yerine, mutant Drp1'in mitokondrinin perinükleer kümelere çökmesine neden olduğunu bulduk, bu da Drp1'in mitokondriyal morfolojiyi (Smirnova) spesifik olarak etkilediğini gösterir. ve diğerleri, 1998). Mitokondriyal kümelenmeyi indükleyen altta yatan kusur belirsizliğini koruyor.

Şimdi mitokondriyal kümelerin, mitokondriyal bölünmedeki bir kusurdan beklendiği gibi, birbirine oldukça bağlı bir mitokondri ağı içerdiğini gösteriyoruz. Ayrıca mitokondri boyunca noktalarda lokalize olan endojen Drp1'in bir kısmını tespit edebiliyoruz ve hızlandırılmış fotoğrafçılık kullanımıyla mitokondriyal bölünme olaylarıyla GFP etiketli Drp1'in kollokalizasyonunu tespit edebiliyoruz. Drp1'in memeli hücrelerinde olduğu gibi mitokondriyal bölünmeye katkıda bulunduğu sonucuna vardık. C. elegans ve maya içinde.


Videoyu izle: LEUKOSIT BIOLOGI (Temmuz 2022).


Yorumlar:

  1. Hewitt

    Bence yanılıyorlar. Bana PM'de yaz, konuş.

  2. Brookson

    Özür dilerim, hiçbir şeye yardım edemem. Bence doğru kararı bulacaksınız.

  3. Markos

    saçmalık .. Neden ..

  4. Tujas

    Bu konuda aldanmayın.

  5. Zolokazahn

    Üzgünüm, ama bence hatalar yapılır. tartışmayı teklif ediyorum. Bana PM'den yaz.

  6. Keir

    onaylıyorum. Ve bununla karşılaştım.

  7. Ansel

    Rasgele bir forum geldi ve bu temayı gördü. Konseyde sana yardım edebilirim. Birlikte karar verebiliriz.



Bir mesaj yaz