Bilgi

1.5: Algoritmalara ve olasılıksal çıkarsamalara giriş - Biyoloji

1.5: Algoritmalara ve olasılıksal çıkarsamalara giriş - Biyoloji


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

1. Örneğin, uzunluğu 4 olan bir motif için aşağıdaki PWM'yi göz önünde bulundurun:

Bu motifin 4 uzunlukta diziler üretebileceğini söylüyoruz. PWM'ler tipik olarak bir pozisyonun dağılımının başka bir pozisyonun tabanından etkilenmediğini varsayar. Her pozisyonun nükleotidler üzerinde bir olasılık dağılımı ile ilişkili olduğuna dikkat edin (toplamları 1'dir ve negatif değildirler).

2. Nükleotidlerin arka plan dağılımını da modelleyebiliriz (genomda bulunan dağılım):

A ve T olasılıklarının nasıl aynı olduğuna ve G ve C olasılıklarının nasıl aynı olduğuna dikkat edin. Bu, A ve T, G ve C'nin genel bileşiminin genomda genel olarak aynı olmasını sağlayan tamamlayıcılık DNA'sının bir sonucudur.

3. (S = GCAA.) dizisini göz önünde bulundurun.

  • Bu diziyi oluşturan motifin olasılığı [P(S|M) = 0.4 × 0.25 × 0.1 × 1.0 = 0.01'dir. umara yok]
  • Bu diziyi oluşturan arka planın olasılığı [P (S|B) = 0.4 × 0.4 × 0.1 × 0.1 = 0.0016. umara yok]

4. Tek başına bu özellikle ilginç değil. Bununla birlikte, motif tarafından üretilen dizilerin belirli bir kısmı, ör. P(M) = 0.1 ve diğer tüm dizilerin arka plan tarafından üretildiğini varsayarak (P(B) = 0.9) Bayes Kuralını kullanarak motifin diziyi oluşturma olasılığını hesaplayabiliriz:

[egin{align*} P(M|S) &= frac{P(S|M)P(M)}{P(S)} [4pt] &= frac{P(S| M)P(M)}{P(S|B)P(B)+P(S|M)P(M)} [4pt] &= frac{0.01 imes 0.1}{0.0016 imes 0.9 + 0.01 imes 0.1} = 0.40984 end{align*}]


Videoyu izle: 12 Sınıf Biyoloji Dersi Fotonsentez 6 (Temmuz 2022).


Yorumlar:

  1. Mutaxe

    ICQ'daki bir arkadaşa bir bağlantı vereceğim :)

  2. Voodoom

    Evet, düşünmeliyim, buna özel dikkat etmem, eylemleri yeniden gözden geçirmem ve oraya gitmem gerekecek, böylece blogum hayata geçecek, aksi takdirde sadece bok tonları (spam) gerçekten iyi Post, yazara saygı.

  3. Malvyn

    Sizi kesintiye uğrattığım için özür dilerim, başka bir rotadan aşağı inme önerisi var.

  4. Senghor

    Size hiçbir şey konusunda yardımcı olamadığım için üzgünüm, ama eminim doğru çözümü bulmanıza yardımcı olacaklar.



Bir mesaj yaz